Kokh, Daria B.: шукати на сайті Z-Library

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024 Про збір коштів

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Книги
Статті (33)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

1

Modeling and simulation of protein–surface interactions: achievements and challenges

Ozboyaci, Musa, Kokh, Daria B., Corni, Stefano, Wade, Rebecca C.

Журнал:

Quarterly Reviews of Biophysics

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.36 MB

english, 2016

2

Receptor flexibility in small-molecule docking calculations

Daria B. Kokh, Rebecca C. Wade, Wolfgang Wenzel

Журнал:

Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 542 KB

english, 2011

3

Kinetics for Drug Discovery: an industry-driven effort to target drug residence time

Schuetz, Doris A., de Witte, Wilhelmus Egbertus Arnout, Wong, Yin Cheong, Knasmueller, Bernhard, Richter, Lars, Kokh, Daria B., Sadiq, S. Kashif, Bosma, Reggie, Nederpelt, Indira, Heitman, Laura H., S

Журнал:

Drug Discovery Today

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 937 KB

english, 2017

4

New approaches for computing ligand–receptor binding kinetics

Bruce, Neil J, Ganotra, Gaurav K, Kokh, Daria B, Sadiq, S Kashif, Wade, Rebecca C

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.42 MB

english, 2018

5

Estimation of Drug-Target Residence Times by τ-Random Acceleration Molecular Dynamics Simulations

Kokh, Daria B., Amaral, Marta, Bomke, Joerg, Grädler, Ulrich, Musil, Djordje, Buchstaller, Hans-Peter, Dreyer, Matthias K., Frech, Matthias, Lowinski, Maryse, Vallee, Francois, Bianciotto, Marc, Rak,

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.98 MB

english, 2018

6

Recent progress in molecular simulation methods for drug binding kinetics

Nunes-Alves, Ariane, Kokh, Daria B, Wade, Rebecca C

Журнал:

Current Opinion in Structural Biology

Рік:

2020

Файл:

PDF, 1.67 MB

2020

7

A Quantitative, Real-Time Assessment of Binding of Peptides and Proteins to Gold Surfaces

Ori Cohavi, Dr. Dana Reichmann, Renne Abramovich, Alexander B. Tesler, Dr. Giuliano Bellapadrona, Dr. Daria B. Kokh, Dr. Rebecca C. Wade, Dr. Alexander Vaskevich, Prof. Israel Rubinstein, Prof. Gideon

Журнал:

Chemistry - A European Journal

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 639 KB

english, 2011

8

Protein–surface interactions: challenging experiments and computations

Ori Cohavi, Stefano Corni, Francesca De Rienzo, Rosa Di Felice, Kay E. Gottschalk, Martin Hoefling, Daria Kokh, Elisa Molinari, Gideon Schreiber, Alexander Vaskevich, Rebecca C. Wade

Журнал:

Journal of Molecular Recognition

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 82 KB

english, 2010

9

High throughput in-silico screening against flexible protein receptors

Horacio Pérez-Sánchez, Bernhard Fischer, Daria Kokh, Holger Merlitz, Wolfgang Wenzel

Журнал:

Journal of Cheminformatics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 147 KB

english, 2010

10

Diffusion and association processes in biological systems: theory, computation and experiment

Paolo Mereghetti, Daria Kokh, J Andrew McCammon, Rebecca C Wade

Журнал:

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 198 KB

english, 2011

11

Trends in adsorption of open-shell atoms and small molecular fragments on the Ag(1 1 1) surface

Daria B. Kokh, Robert J. Buenker, Jerry L. Whitten

Журнал:

Surface Science

Рік:

2006

Мова:

english

Файл:

PDF, 463 KB

english, 2006

12

Docking of Ubiquitin to Gold Nanoparticles

Brancolini, Giorgia, Kokh, Daria B., Calzolai, Luigi, Wade, Rebecca C., Corni, Stefano

Журнал:

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.09 MB

english, 2012

13

TRAPP: A Tool for Analysis of Tra nsient Binding P ockets in P roteins

Kokh, Daria B., Richter, Stefan, Henrich, Stefan, Czodrowski, Paul, Rippmann, Friedrich, Wade, Rebecca C.

Журнал:

Journal of Chemical Information and Modeling

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.45 MB

english, 2013

14

Theoretical study of the UV photodissociation of Cl[sub 2]: Potentials, transition moments, extinction coefficients, and Cl∗/Cl branching ratio

Kokh, Daria B., Alekseyev, Aleksey B., Buenker, Robert J.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2004

Мова:

english

Файл:

PDF, 445 KB

english, 2004

15

Modeling of Protein Adsorption on a Metal Surface: Brownian Dynamics Simulations

Kokh, Daria B., Huang, Bingding, Wade, Rebecca C., Winn, Peter J.

Журнал:

Biophysical Journal

Рік:

2009

Мова:

english

Файл:

PDF, 53 KB

english, 2009

16

ProMetCS: An Atomistic Force Field for Modeling Protein−Metal Surface Interactions in a Continuum Aqueous Solvent

Kokh, Daria B., Corni, Stefano, Winn, Peter J., Hoefling, Martin, Gottschalk, Kay E., Wade, Rebecca C.

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.34 MB

english, 2010

17

Flexible Side Chain Models Improve Enrichment Rates in In Silico Screening

Kokh, Daria B., Wenzel, Wolfgang

Журнал:

Journal of Medicinal Chemistry

Рік:

2008

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.06 MB

english, 2008

18

HI Photofragmentation Revisited. Comment on “Probing Excited Electronic States Using Vibrationally Mediated Photolysis: Application to Hydrogen Iodide”

Alekseyev, Aleksey B., Kokh, Daria B., Buenker, Robert J.

Журнал:

Journal of Physical Chemistry A

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 78 KB

english, 2005

19

Nonadiabatic effects in the lowest 0[sup +]([sup 3]P) ion-pair states of CIF

Kokh, Daria B., Li, Yan, Buenker, Robert J., Alekseyev, Aleksey B., Liebermann, Heinz-Peter, Alekseev, Vadim A.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 353 KB

english, 2001

20

Relativistic configuration interaction study of the ClF molecule and its emission spectra from 0+ ion-pair states

Alekseyev, Aleksey B., Liebermann, Heinz-Peter, Buenker, Robert J., Kokh, Daria B.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 432 KB

english, 2000

21

The lowest 1([sup 3]P[sub J]) and 2([sup 3]P[sub 2]) ion-pair states of ClF: Nonadiabatic effects and emission spectra

Kokh, Daria B., Alekseyev, Aleksey B., Li, Yan, Buenker, Robert J.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2002

Мова:

english

Файл:

PDF, 378 KB

english, 2002

22

On the ultraviolet photofragmentation of hydrogen iodide

Alekseyev, Aleksey B., Liebermann, Heinz-Peter, Kokh, Daria B., Buenker, Robert J.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 397 KB

english, 2000

23

Photodissociation of CH[sub 3]Cl, C[sub 2]H[sub 5]Cl, and C[sub 6]H[sub 5]Cl on the Ag(111) surface: Ab initio embedded cluster and configuration interaction study

Kokh, Daria B., Liebermann, Heinz-Peter, Buenker, Robert J.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 894 KB

english, 2010

24

When the label matters: Adsorption of labelled and unlabelled proteins on charged surfaces

Romanowska, Julia, Kokh, Daria B., Wade, Rebecca C

Журнал:

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.61 MB

english, 2015

25

Theoretical Study of the CH 2 + O Photodissociation of Formaldehyde Adsorbed on the Ag(111) Surface

Kokh, Daria B., Buenker, Robert J., Liebermann, Heinz-Peter, Pichl, Lukáš, Whitten, Jerry L.

Журнал:

Journal of Physical Chemistry B

Рік:

2005

Мова:

english

Файл:

PDF, 433 KB

english, 2005

26

SDA 7: A modular and parallel implementation of the simulation of diffusional association software

Martinez, Michael, Bruce, Neil J., Romanowska, Julia, Kokh, Daria B., Ozboyaci, Musa, Yu, Xiaofeng, Öztürk, Mehmet Ali, Richter, Stefan, Wade, Rebecca C.

Журнал:

Journal of Computational Chemistry

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 911 KB

english, 2015

27

Protein Binding Pocket Dynamics

Stank, Antonia, Kokh, Daria B., Fuller, Jonathan C., Wade, Rebecca C.

Журнал:

Accounts of Chemical Research

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.55 MB

english, 2016

28

Theoretical Study of the Photoinduced C−H Bond Cleavage in Formaldehyde Adsorbed on the Ag(111) Surface

Kokh, Daria B., Buenker, Robert J., Liebermann, Heinz-Peter, Whitten, Jerry L.

Журнал:

The Journal of Physical Chemistry C

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 232 KB

english, 2007

29

Perturbation Approaches for Exploring Protein Binding Site Flexibility to Predict Transient Binding Pockets

Kokh, Daria B., Czodrowski, Paul, Rippmann, Friedrich, Wade, Rebecca C

Журнал:

Journal of Chemical Theory and Computation

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.99 MB

english, 2016

30

TRAPP webserver: predicting protein binding site flexibility and detecting transient binding pockets

Stank, Antonia, Kokh, Daria B., Horn, Max, Sizikova, Elena, Neil, Rebecca, Panecka, Joanna, Richter, Stefan, Wade, Rebecca C.

Журнал:

Nucleic Acids Research

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.74 MB

english, 2017

31

Machine Learning Analysis of τRAMD Trajectories to Decipher Molecular Determinants of Drug-Target Residence Times

Kokh, Daria B., Kaufmann, Tom, Kister, Bastian, Wade, Rebecca C.

Журнал:

Frontiers in Molecular Biosciences

Рік:

2019

Мова:

english

Файл:

PDF, 7.23 MB

english, 2019

32

Druggability Assessment in TRAPP using Machine Learning Approaches

Yuan, Jui-Hung, Han, Sungho Bosco, Richter, Stefan, Wade, Rebecca C, Kokh, Daria B.

Журнал:

Journal of Chemical Information and Modeling

Рік:

2020

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.67 MB

english, 2020

33

A workflow for exploring ligand dissociation from a macromolecule: Efficient random acceleration molecular dynamics simulation and interaction fingerprint analysis of ligand trajectories

Kokh, Daria B., Doser, Bernd, Richter, Stefan, Ormersbach, Fabian, Cheng, Xingyi, Wade, Rebecca C.

Журнал:

The Journal of Chemical Physics

Рік:

2020

Файл:

PDF, 5.28 MB

2020